En résumé, il s'agit de deux frères, alchimistes, qui ont un jour utilisé l'alchimie pour ramener à la vie leur mère décédée - leur père étant lui, parti. L'expérience a échouée, avec des dommages collatéraux plutôt embarrassants pour les deux frères. Du coup, pour réparer ces dégâts, ils parcourent le pays à la recherche d'une pierre philosophale qui leur permettra de retrouver ce qu'ils ont jadis perdu. Sauf que ce faisant, ils vont prendre pied dans un complot qu'ils ne soupçonnaient pas.
L'histoire est vraiment très prenante et, fait rare, chaque perso qui sera introduit dans l'histoire aura vraiment quelque chose de marquant tant Arakawa s'est attachée au développement de ses persos.